Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl18aP62717 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms