Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snap25P60879 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snap25P60879 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms