Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms