Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CtnsP57757 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms