Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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NcstnP57716 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NcstnP57716 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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