Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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