Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bace1P56818 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms