Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rrp1P56183 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms