Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NrlP54846 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NrlP54846 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrlP54846 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NrlP54846 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms