Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lbx1P52955 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lbx1P52955 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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