Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgd1P52734 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms