Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CcnfP51944 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CcnfP51944 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CcnfP51944 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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