Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Defa6P50704 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Defa6P50704 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms