Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TspoP50637 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TspoP50637 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TspoP50637 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms