Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CitP49025 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CitP49025 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CitP49025 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CitP49025 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CitP49025 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CitP49025 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CitP49025 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CitP49025 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms