Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms