Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms