Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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