Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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