Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Timp3P39876 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Timp3P39876 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms