Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddit3P35639 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddit3P35639 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms