Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2aP35436 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2aP35436 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms