Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp4P35123 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp4P35123 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp4P35123 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Usp4P35123 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp4P35123 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Usp4P35123 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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