Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mmp13P33435 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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