Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxc5P32043 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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