Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Saa4P31532 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Saa4P31532 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms