Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms