Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DesP31001 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DesP31001 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DesP31001 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DesP31001 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms