Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col2a1P28481 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col2a1P28481 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms