Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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