Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Aco1P28271 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Aco1P28271 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms