Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PdgfraP26618 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PdgfraP26618 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PdgfraP26618 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PdgfraP26618 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfraP26618 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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