Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms