Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms