Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Znf239P24399 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Znf239P24399 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Znf239P24399 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms