Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RarbP22605 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RarbP22605 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RarbP22605 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RarbP22605 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RarbP22605 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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