Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk1P22518 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk1P22518 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk1P22518 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Clk1P22518 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clk1P22518 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clk1P22518 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Clk1P22518 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clk1P22518 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms