Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PrkcaP20444 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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