Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P20040 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
P20040 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
P20040 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
P20040 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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