Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpl13aP19253 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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