Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc1P19123 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms