Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka1P18653 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms