Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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PtpraP18052 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpraP18052 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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