Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxb1P17919 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms