Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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