Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtcP11725 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtcP11725 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtcP11725 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtcP11725 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtcP11725 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtcP11725 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtcP11725 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms