Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Defa1P11477 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Defa1P11477 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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