Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp1P11438 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp1P11438 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms