Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RaraP11416 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RaraP11416 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RaraP11416 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RaraP11416 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RaraP11416 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RaraP11416 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms