Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prf1P10820 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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